Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROB1E7EW31 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms