Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Soga1E1U8D0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Soga1E1U8D0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Soga1E1U8D0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms