Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptrhd1D3Z4S3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptrhd1D3Z4S3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptrhd1D3Z4S3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptrhd1D3Z4S3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptrhd1D3Z4S3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptrhd1D3Z4S3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms