Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptprz1B9EKR1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms