Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tmf1B9EKI3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tmf1B9EKI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms