Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Phf11bB4XVQ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Phf11bB4XVQ1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms