Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apba1B2RUJ5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apba1B2RUJ5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms