Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp42B2RQC2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp42B2RQC2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp42B2RQC2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms