Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nipsnap3aB1AWZ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms