Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RIMBP3BA6NNM3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RIMBP3BA6NNM3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RIMBP3BA6NNM3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RIMBP3BA6NNM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RIMBP3BA6NNM3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RIMBP3BA6NNM3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RIMBP3BA6NNM3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
RIMBP3BA6NNM3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
RIMBP3BA6NNM3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
RIMBP3BA6NNM3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.4 ms