Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE9

PRSS29P, Putative serine protease 29, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS29PA6NIE9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRSS29PA6NIE9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRSS29PA6NIE9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRSS29PA6NIE9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRSS29PA6NIE9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PRSS29PA6NIE9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS29PA6NIE9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS29PA6NIE9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRSS29PA6NIE9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS29PA6NIE9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS29PA6NIE9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS29PA6NIE9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS29PA6NIE9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS29PA6NIE9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRSS29PA6NIE9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms