Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Col9a3A2ACT7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col9a3A2ACT7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col9a3A2ACT7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms