Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm27029A2A4P4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm27029A2A4P4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm27029A2A4P4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm27029A2A4P4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms