Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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