Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm6S4R1W5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rbm6S4R1W5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rbm6S4R1W5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms