Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Knop1Q9Z2Q2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Knop1Q9Z2Q2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Knop1Q9Z2Q2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms