Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z126

Pf4, Platelet factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pf4Q9Z126 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pf4Q9Z126 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pf4Q9Z126 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pf4Q9Z126 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 547.8 ms