Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Nup160Q9Z0W3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Nup160Q9Z0W3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nup160Q9Z0W3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms