Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms