Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRP12Q9Y561 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRP12Q9Y561 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms