Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCL27Q9Y4X3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCL27Q9Y4X3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL27Q9Y4X3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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