Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOD1Q9Y239 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOD1Q9Y239 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms