Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apobec2Q9WV35 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec2Q9WV35 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms