Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gabbr1Q9WV18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabbr1Q9WV18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabbr1Q9WV18 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms