Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stub1Q9WUD1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stub1Q9WUD1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Stub1Q9WUD1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms