Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Sema6cQ9WTM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema6cQ9WTM3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema6cQ9WTM3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms