Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Col4a4Q9QZR9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Col4a4Q9QZR9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms