Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDP2Q9P2J9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP2Q9P2J9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP2Q9P2J9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP2Q9P2J9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDP2Q9P2J9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDP2Q9P2J9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDP2Q9P2J9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDP2Q9P2J9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDP2Q9P2J9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDP2Q9P2J9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms