Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TMOD3Q9NYL9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
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TMOD3Q9NYL9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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TMOD3Q9NYL9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TMOD3Q9NYL9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TMOD3Q9NYL9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
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