Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZDHHC3Q9NYG2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZDHHC3Q9NYG2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms