Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRMT1Q9NXH9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRMT1Q9NXH9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms