Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF19Q9NS68 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF19Q9NS68 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms