Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CMC2Q9NRP2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CMC2Q9NRP2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms