Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO8Q9NRD0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.3 ms