Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Edf1Q9JMG1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Edf1Q9JMG1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms