Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc2lQ9JME7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms