Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bgrlQ9JJU8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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