Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc22Q9JIG7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms