Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LratQ9JI60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LratQ9JI60 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms