Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCLRE1BQ9H816 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms