Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLSTN2Q9H4D0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLSTN2Q9H4D0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLSTN2Q9H4D0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms