Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R5

CENPH, Centromere protein H, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPHQ9H3R5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPHQ9H3R5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPHQ9H3R5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms