Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
POLR1EQ9GZS1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1EQ9GZS1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms