Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
OtofQ9ESF1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
OtofQ9ESF1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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