Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ms4a4bQ9ES61 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a4bQ9ES61 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a4bQ9ES61 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms