Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ubiad1Q9DC60 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ubiad1Q9DC60 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubiad1Q9DC60 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms