Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SrpraQ9DBG7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SrpraQ9DBG7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SrpraQ9DBG7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms