Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf4Q9DAW6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf4Q9DAW6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf4Q9DAW6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms