Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vstm5Q9D806 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vstm5Q9D806 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms