Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Taf1dQ9D4V4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Taf1dQ9D4V4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Taf1dQ9D4V4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Taf1dQ9D4V4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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